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Table 5 497 bp of 16S sequenced for 62 individuals of P. chalceus and 15 of P. littoralis.

From: Inter- and intraspecific genetic and morphological variation in a sibling pair of carabid species

TTTATCAAAAACATGTCTTTTTGAGTTTAATATAAAGTCTAxCCTGCCCACTGAAAxTTTTAAATGGCCGCAGTAATTTGACTGTGCAAAGGTAGCATAATCT

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .1 . . . . . . . . . . . . .2 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

TAGTTTTTTAATTGAAAGCTTGTATGAAAGGTTGGACGAGGTAAAATCTGTCTCTATTTAATTTAxATTAGAATTTAATTTTTAAGTTAAAAAGCTTAAATTTT

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

TTTAAAAGACGAGAAGACCCTATAGAGCTTTATAATTTATTTAATATAATTAATTTAGATTTATTTATATTTTATTxTTxAAATTATTTTATTGGGGTAATAGA

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .4 . 5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

AGATTAAAAAAATTCTTTTTTTTTATTTATATTxxTTTATxTTTTxAATGATCCAxTTTTATTGATTATAAGATTAAGTTACCTTAGGGATAACAGCGTAATTTTT

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .67 . . . .8 9 . . . 10 . . . . . . . .11. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

TGGAGAGTTCAT ATCGATAAAAAAGTTTGCGACCTCGATGTTGGATTAAAGATTAGTTTAGGTGTAGAAGTTTAAA

. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .

 

Haplotype sequence information

Haplotype No.

1

2

3

4

5

6

7

8

9

10

11

   

1

G

T

G

T

A

T

A

A

 

T

T

   

2

G

T

G

T

A

T

A

  

T

T

   

3

A

A

A

A

T

A

G

A

G

A

G

   
 

Frequency of haplotypes

 

POGONUS CHALCEUS

POGONUS LITTORALIS

Haplotype No.

CANAL1

POND1

MOK

ZWC

HEI

OOS

NIE

SOM

MSM

CAMA

ALB

GUE1

ZWC

ROU

1

6

6

5

6

7

4

5

5

7

5

5

   

2

   

1

          

3

           

6

5

4

  1. Bold lower case letters indicate variable positions numbered from 1 to 11 which are not position numbers in the gene. Dots indicate invariable positions. The table shows the variable sites 1–11 of the haplotypes. The table below shows the haplotype frequency in each population.